组织的最高管理者应当对ISO9001认证审核的方案管理进行授权，明确审核方案的管理者如下的职责和权限：
1、确定ISO9001认证审核方案的目标和范围;
2、确定职责、资源和程序;
3、建立并实施审核方案的实施;
4、监视、评审和改进审核方案;
5、保存审核方案记录。
根据被审核组织的规模、性质和复杂程度，ISO9001认证审核方案可能有多个不同的目的，一个审核方案可以包括一次或多次的审核，或者是质量和环境的结合审核；或几家ISO9001认证机构的联合审核。组织也可以建立多个审核方案。审核方案的管理者应按赋予其的职责和权限对审核方案进行全过程的管理。
在进行质量管理体系和环境管理体系的一体化审核时，应特别注意审核组的能力。
两个或两个以上的审核组织进行合作实施联合审核时，特别应注意各自职责的划分、附加资源的提供、审核组的能力需要以及适宜的程序。在审核开始前，应就这些事项取得一致意见。
在ISO9001质量认证第三方审核中，通常由认证机构的最高管理者授权给审核方案的管理者在内部审核中，组织的最高管理者通常任命管理者代表或质管办主任担任内部审核方案的管理者来管理内部审核方案。

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